Misión: contribuir al conocimiento científico y tecnológico de los ecosistemas marinos y costeros, mediante investigaciones interdisciplinarias. Promover el desarrollo sostenible y la conservación de los recursos marinos y costeros, abordando desafíos globales como el cambio climático, la contaminación acuática y la degradación ambiental. Ofrecer servicios especializados a empresas y la comunidad, incluyendo asesorías técnicas, cuantificación de analitos y desarrollo de soluciones para la gestión ambiental. Fomentar la transferencia de conocimientos hacia políticas públicas, educación y actividades productivas, fortaleciendo la conexión entre la ciencia, la sociedad y el medio ambiente.
Visión: Liderar la creación y difusión de saberes científicos, tecnológicos, socioecológicos y económicos que contribuyan en la gestión, protección y preservación de recursos oceánicos, marinos, costeros y limnológicos bajo la premisa de la cooperación internacional en innovación y formación de profesionales de alta cualificación.