- Evaluación de la biodiversidad mediante técnicas de sistemática tradicional y molecular (BARCODE).
- Evolución y filogenia.
- Bioecología: dinámica espacio-temporal de las comunidades algales relacionadas con procesos físicos, químicos, geológicos y biológicos.
- Impacto de las actividades antrópicas sobre la estructura de las comunidades.
- Eutrofización y biorremediación.
- Relaciones interespecíficas y patología algal: estado sanitario de las poblaciones y herbivoría.