A través de esta línea se busca interpretar los ciclos naturales que cumplen los compuestos nutritivos (de nitrógeno, fósforo y silicio) así como algunas sustancias contaminantes (metales pesados, TBTs, PAHs, pesticidas y PCBs.) en ecosistemas costeros. Además de identificar los mecanismos de transferencia, balances entre compartimientos y sistemas de aportes de estas sustancias, se intenta establecer la influencia antrópica sobre esos procesos. Finalmente, a través de lasseries de datos que se obtengan se podrá establecer el estado ecofisiológico de los sistemas estudiados, y predecir algunos comportamientos futuros.
